Quatre ans après la défaite de l'armée du dictateur lors du premier opus, les forces de guérilla restantes se sont regroupées pour former une nouvelle nation et ont recommencé à attaquer. Une nouvelle force de combat pour le gouvernement rassemble les pilotes du premier escadron de Gun Dogs et leur ordonne d'entreprendre une nouvelle mission, utilisant une nouvelle génération de chasseurs basés sur l'engin du premier escadron et armés de nouvelles armes.
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