Pretty Cure All Stars New Stage : Mirai no Tomodachi est le film qui réuni l'ensemble des Pretty Cure des séries précédentes, y compris Smile Pretty Cure ! et une Pretty Cure exclusive dont le nom est Cure Echo.
Dans la ville de Minato Mirai à Yokohama, la nouvelle de la défaite de Fusion face aux Pretty Cures est le sujet le plus brûlant de la ville ! Toutes les filles sont fan des Pretty Cures, se déguisent et agissent comme leurs Cures préférées.
En rentrant de l'école, Sakagami Ayumi rencontre une étrange créature. Après l'avoir nommé Fuu-chan, Ayumi et la créature deviennent rapidement de bons amis. Cependant, Fuu-chan est en fait un morceau de Fusion et détient le pouvoir des ténèbres. Dans un effort pour rendre Ayumi heureuse, Fuu-chan avale tout ce qu'Ayumi n'aime pas, créant le chaos à l'école et dans toute la ville !
Pour aider à faire passer les vrais sentiments d'Ayumi à Fuu-chan, les 28 Pretty Cures ont été réunis une fois de plus. Lorsque le pouvoir de chacun se rassemble, une lumière miraculeuse commence à briller.